刘原
主任医师 教授
副院长
呼吸与危重症医学科杨拴盈
主任医师 教授
科主任
呼吸与危重症医学科董西林
主任医师 教授
3.9
呼吸与危重症医学科方萍
主任医师 副教授
3.9
呼吸与危重症医学科孙秀珍
主任医师 教授
3.8
呼吸与危重症医学科李雅莉
主任医师 教授
3.8
呼吸与危重症医学科张德信
副主任医师 副教授
3.8
呼吸与危重症医学科杨侠
主任医师 副教授
3.8
呼吸与危重症医学科刘昀
主任医师 副教授
3.8
呼吸与危重症医学科薛淑芳
主任医师 教授
3.7
张洁
主任医师 教授
3.7
呼吸与危重症医学科和平
副主任医师 副教授
3.7
呼吸与危重症医学科史红阳
副主任医师
3.7
呼吸与危重症医学科王春亚
副主任医师
3.6
呼吸与危重症医学科明宗娟
副主任医师
3.6
呼吸与危重症医学科张明
副主任医师
3.6
呼吸与危重症医学科吴媛媛
副主任医师
3.6
呼吸与危重症医学科石婕
副主任医师
3.6
呼吸与危重症医学科李维
主治医师
3.6
呼吸与危重症医学科张秋红
主治医师
3.6
张永红
主治医师
3.6
呼吸与危重症医学科单虎
主治医师
3.6
呼吸与危重症医学科樊娜
主治医师
3.6
呼吸与危重症医学科于俊霞
主治医师
3.6
呼吸与危重症医学科钟玉洁
医师
3.5
呼吸与危重症医学科邓文静
医师
3.5
呼吸与危重症医学科柯蕊
医师
3.5
呼吸与危重症医学科宁璞
医师
3.5
呼吸与危重症医学科曹渊
医师
3.5
呼吸与危重症医学科王蕾
医师
3.5
葛娟
医师
3.5
呼吸与危重症医学科王煜
医师
3.5
呼吸与危重症医学科徐浩
医师
3.5
呼吸与危重症医学科袁竞妍
医师
3.5
普通内科杨德昌
主任医师 教授
3.2
张梦颖
医师
呼吸内科 牛泽群 硕士研究生 杨拴盈 教授慢性肺源性心脏病简称慢性肺心病,是我国的一种常见病。东北、西北、华北地区患病率高于南方地区,农村患病率高于城市,并随年龄增高而增加。冬季气候干燥、寒冷,极易诱发呼吸道感染,使肺心病加重和恶化。因此,肺心病患者做好预防工作,对安全过冬尤为重要。第一:防止上呼吸道感染上呼吸道感染是肺心病急性发作的主要诱因。因此,肺心病患者应严防上呼吸道感染。平时要加强锻炼,多到户外空气新鲜的环境中练习深呼吸,吹口哨,缩唇呼吸,以改善呼吸肌力量,增加肺活量,增强机体免疫力;注意御寒,防止冷空气刺激;随气候变化增减衣物,以免引起感冒而加重病情。此外冬季还应注意居室的温度、湿度,定时开窗通风,保持空气流通新鲜。第二:保持呼吸道通畅通气障碍是肺心病加重的主要因素。所以,必须设法保持呼吸道通畅。痰咳不出,会加重呼吸道阻塞;多饮水、热蒸汽或雾化吸入有利于湿润呼吸道,稀释稠痰;多活动、有意识咳嗽等均有利于痰液排出。当然,配合服用氨溴索等化痰药物效果更好。第三:家庭吸氧治疗吸氧可明显减缓肺心病的进展,降低肺动脉压力,减少肺心病病死率,是迄今延长肺心病患者生存时间最可靠的方法之一。肺心病加重期的氧疗原则是:长期、持续、低流量(1~23升/分钟)吸氧。一般应持续每天14小时以上,间歇应在白天,睡眠时不要间断。近年,吸氧疗法已普及到家庭。第四:加强饮食调养肺心病人呼吸所消耗的能量要比正常人大,又因内脏淤血、水肿而食欲差,吸收又不佳。所以,多数病人营养不良,体重减轻,低蛋白血症,免疫力低下,容易导致感染,加重病情,以此形成恶性循环。因此,调节肺心病的饮食营养是十分重要的。应给病人以优质蛋白(蛋、奶、鱼等)及富含维生素、纤维素、易消化的饮食(如水果和蔬菜等),不要过度限盐,因为低盐可加重乏力、食欲不振,甚至恶心、呕吐,加重营养不良。但有水肿及心功能不全的病人应控制食盐量,以免加重呼吸和心脏负担。当然,保持大便通畅对于肺心病患者也是很重要的。如果条件许可,可在医师指导下服用冬虫夏草、胸腺肽等,可提高免疫力,香菇、菌类对提高免疫力也有一定的作用。第五:发病及时治疗肺心病急性发作或病情加重时,应在医生指导下及时治疗,避免病情进一步加重,并加强护理。
南岩东1 杨拴盈2 金发光1 田应选3 霍淑芬2 杜洁4(1.第四军医大学唐都医院呼吸内科,西安 717308;2. 西安交通大学第二附属医院呼吸内科,西安 710004;3.陕西省人民医院老年呼吸科 710068;4.陕西省人民医院内科 710068)摘要:目的:应用高通量蛋白质组学及生物信息学技术分析肺鳞癌表达蛋白质谱,筛选肺癌标志蛋白质,为肺鳞癌发病机制、早期诊断及治疗提供有价值的线索。方法:6例手术后新鲜肺鳞癌组织,通过激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)分离纯化肿瘤细胞并提取可溶性总蛋白;多维液相色谱-离子阱串联质谱技术(也称鸟枪法蛋白质组学,shot-gun proteomics)对蛋白质进行分离、鉴定;进一步通过生物信息学工具预测肺鳞癌细胞表达蛋白质的理化性质、分子功能、生物通路及蛋白质相互作用,并筛选潜在的标志蛋白。结果:LCM共收集60个cap,平均每个LCM-cap收集感兴趣细胞数约12000个,其同质性大于95%。可溶性总蛋白经多维液相色谱-离子阱串联质谱共鉴定出860个非冗余蛋白质。蛋白质的理化性质包括分子量、等电点、平均疏水性、跨膜结构域、亚细胞定位、转录后修饰和组织分布经过在线生物信息学工具分析;蛋白质生物学功能基于GO软件和KEGG生物学通路分析,根据其注解,筛选出3个有价值的蛋白质,即分裂素活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MHPK),粘联素A1(annexin A1,ANXA1),高移动组蛋白B1(high mobility group protein B1,HMGPB1)作为肺鳞癌候选的标志蛋白。结论:鸟枪法蛋白质组学可大规模分离、鉴定肿瘤细胞表达蛋白质,基于生物信息学筛选的标志蛋白质可能成为肺癌诊断和治疗的分子靶点。关键词:肺鳞癌;鸟枪法蛋白质组学;生物信息学;分子功能;标志蛋白质ABSTRACT: Objective To explore the pathogenesis and screen biomarkers of early diagnosis and treatment for lung squamous cell carcinoma (SQCC).Methods: Tumor cells were isolated and purified bylaser capture microdissection(LCM)from 6 cases of fresh tissue of lung SQCC after operatoin and total solution proteins were extracted. Proteins were isolate and identified by mutiple dimension liquid chromatography (MDLC) and ion trap tandem mass spectrum technology (Shot-gun Proteomics) . The physio-chemical properties, molecular functoin, biological pathway and interaction of the expressoin proteins were predicted and biomarkers were screened using bioinformatics tools. Results: A total of 60 LCM-caps were collected and about 12000 cells were harvested from every LCM-cap. 860 non–redundant proteins were identified using shot-gun proteomics technology. The physio-chemical properties, including molecular weight (MW), point of isoelectric (PI), grand average of hydropathy (GRAVY), trans-membrane helices (TMH), subcellular location, post-transcription modification (PTM) and tissue distribution were analyzed using bioinformatics tools online and were further indiciated in statistical graph. Biological function was analyzed based on gene ontology (GO) software and kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) biological pathway. Three valuable proteins, including mitogen-activated protein kinase (MHPK), annexin A1 (ANXA1) and high mobility group protein B1(HMGPB1) were screened candidate biomarkers of lung SQCC according to functoin annotatoin.Conclusoin: Shot-gun proteomics can globally isolated and identified the expression protein of tumor cell. The screened biomarkers based on bioinformatics may become molecular target point of dianosis and treatment for lung cancer . KEY WORDS: lung squamous cell carcinoma; shot-gun proteomics; bioinformatics; molecular function; biomarker protien肺癌目前已成为世界范围内发病率最高的恶性肿瘤,缺乏有效的早期诊断及治疗措施,5年生存率不足15%[1]。因此,阐明肺癌发生的分子机制,寻找其特异性靶向蛋白已成为肺癌研究的一项迫切任务。为了大规模、全景式和从整体的角度探索肺鳞癌细胞全蛋白表达谱,我们采用了激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、多维液相色谱-离子阱串联质谱技术(也称鸟枪法蛋白质组学,shot-gun proteomics)对6例肺鳞癌细胞表达蛋白质进行分离、鉴定,进一步通过生物信息学工具预测肺鳞癌细胞表达蛋白质的理化性质、分子功能、生物通路及蛋白质相互作用,并筛选出的3个潜在的标志蛋白,为肺鳞癌发病机制、早期诊断及治疗提供有价值的线索。1 资料与方法1.1 临床资料 从2005年2月至2007年2月共收集6例肺鳞癌患者肿瘤组织,所有患者均具有完整的临床资料、术前未行放疗及化疗、经手术切除、病理证实。其中男5例,女1例; 年龄47-70岁;肿瘤P-TNM分期:Ia期1例, Ib2例, IIb期3例;肿瘤分化:高分化1例,中分化3例,低分化2例。1.2 主要仪器 冰冻切片机(MICROM/HM5000,德国);Pixcell激光捕获仪(ARCUTUROUS Inc,美国);分光光度仪(P-2000,Hitachi公司),纯水装置(Millpore公司),质谱仪(LTQ),MDLC(GE Healthcare)。1.3 主要试剂 所有缓冲液均用Milli-Q 水(Millipore, Bedford, MA, USA)配制。二硫苏糖醇(DTT)、尿素(Urea)、3-胆酰胺丙基-二乙铵-丙磺酸(CHAPS)、三羟甲基氨基乙烷(Tris)、十二烷基磺酸钠(SDS)、Bradford 法定量液等试剂购自Bio-Rad公司(Hercules, CA, USA);碘代乙酰胺(IAA)、过硫酸铵(Ammonium persulphate)、甲酸(Formic acid, FA)、胍(Guanidine)、氯化钠(NaCl)等试剂购自Sigma公司(St. Louis, MO, USA);HPLC级别乙腈(ACN)和甲醇(Methanol)购自Fisher公司(Fair Lawn, NJ, USA);三氟乙酸(TFA)购自Merck公司(Schuchardt, Hohenbrunn, Germany);氢氧化钠购自Fisher(Merck,Darmstadt,German)公司;胰蛋白酶(Trypsin,sequencing grade)购自Promega公司(Madison, WI, USA)。1.4 组织标本的处理 带消毒手套,用无菌剪刀剪取手术后新鲜(30分钟内)肺肿瘤组织,大小约0.4m3,生理盐水反复清洗去除血液,并剪去坏死组织。处理后的组织立即置于-80 ℃保存。1.5 LCM 将组织移入-28℃冰冻切片机,OCT包埋;冰冻切片一张(10mm),常规H&E染色,光学显微镜下观察,确定组织无明显炎症、坏死;对余下的组织冰冻切片(8mm),改良H&E染色,其方法是:将试剂瓶置于冰上,苏木精1s,蒸馏水洗10s(缓慢),伊红10s,85%乙醇10s,90%乙醇10s,无水乙醇Ⅰ10s,无水乙醇Ⅱ10s,二甲苯Ⅰ2min,二甲苯Ⅱ2min;改良H&E染色后的组织切片立即行LCM,条件为:光束直径7.5um,脉冲持续时间15.5ms,光束能量80mW,每张切片捕获时间不超过40分钟。1.6 蛋白质提取及定量 每个LCM cap上的细胞,加裂解液(9.5M尿素,65mM DTT,4%CHAPS,0.2%IPGbuffer,裂解液和酶抑制剂以体积比50:1混合)约20l,吹打cap表面裂解细胞10次,转入离心管中。依次操作组内所有cap,合并在一个离心管中,总体积控制在200 l左右。超声破碎细胞(80W,5次,每次10秒,间隔15秒,冰上完成)。离心,15,000g,45分钟,取上清,加入5倍体积的纯丙酮(-20℃),沉淀蛋白质,去除染色剂。沉淀蛋白质复溶于适量的裂解液中,Bradford法定量,分装成100g/管,置于500l离心管中,-80℃保存。 1.7 蛋白质质谱鉴定 取100g加trypsin,trypsin : protein=1:20-1:50,37℃,20hr; 离心12,000 rpm,4℃,90min, -80℃保存。使用MDLC-LTQ进行分析,C18柱(0.15mm直径,15cm长),自动进样器上样,样品经过C18Trap柱脱盐,然后在C18柱上进行分离(A相为0.1% FA的Millpore水,B相为0.1%FA 84%乙腈水溶液,梯度为2小时内从4%的B相上升到50%的B相),microspray模式。质谱扫描条件设定为一个400—2000的全扫描 (full scan) 后面进行全扫描中前3个最高峰的MS/MS扫描,其中动态排除 (dynamic exclusion)的设定是:重复次数(repeat count)为1,重复容忍时间 (repeat duration)为0.5 min,动态排除时间 (exclusion duration)为3.0 min。1.8 数据库查询 产生的MS/MS用TurboSEQUEST BioWorksTM 3.0软件自动搜索IPI人类蛋白质数据库,所有鉴定得到的肽段数据必须满足以下一些条件:(1) charge=1,XCorr=1.9; charge=2,XCorr= 2.2; charge=3,XCorr= 3.75;(2) Delta Cn= 0.1。同时在Swiss-Prot/TrEMBL和NCBI数据库查询蛋白质,比较不同数据库查询结果。1.9 生物信息学分析 蛋白质分子量(molecular weight, MW)、等电点(piont of isoelectric, PI)、平均疏水性(grand average of hydropathy, GRAVY)通过蛋白质组学网(http://www.expasy.org/tools) 蛋白质专家分析软件(expert proteins analysis system, ExPASy)分析;跨膜结构通过TMHMMv2.0 (http://www. cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0) 软件预测;亚细胞定位基于pTARGET软件(http://bioapps.rit.albany.edu/pTARGET)分析;转录后修饰(post-transcription modification,PTM),包括GPI锚定糖基化(GPI Anchor Glycosylation),O-糖基化,N-糖基化及磷酸化分别通过在线Big-PI Predictor, NetNGlyc 1.0 Server, NetOGlyc3.1 Server和GPS2.0分析。蛋白质功能分类包括分子功能,细胞组分、生物学进程基于Gene Ontology (GO)注解软件(http://http://www.ebi.ac.uk/GOA/)分析。蛋白质生物学通路依赖于kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) http://www.genome.ad.jp/kegg/pathway.html)软件分析,并根据其注解,确定与肿瘤发生密切相关的关键信号通路,初步筛选肺鳞癌标志蛋白质。2 结果2.1 蛋白质定量:6例肺鳞癌组织标本经LCM共收集60个cap,平均每个LCM-cap收集感兴趣细胞数约12000个;高倍光学显微镜观察,LCM-cap上肺鳞癌细胞的同质性大于95%。分别于丙酮沉淀前后,先对单个LCM cap上细胞提取的蛋白质行Bradoford法定量,然后对总共60LCM cap上细胞提取的蛋白质行Bradoford法定量,其结果如表1。表1 丙酮沉淀前后可溶性蛋白质定量结果丙酮沉淀单个cap蛋白质 (g) ( ±s)总蛋白(g)前4.14±0.36248.20后1.69±0.12101.892.2 蛋白质鉴定:使用MDLC,C18Trap柱脱盐,分离2小时,获得了LCM肺鳞癌细胞表达蛋白质酶解肽段的总离子流图。LC分离后的混合肽段,经电喷雾离子阱串联质谱,先由第一级质量分析器获得其一级质谱图,然后在一级质谱图中挑选出需要进一步分析的母离子进入碰撞室碰撞诱导解离(collision- induced dissociation, CID),产生碎片离子获得二级质谱图,并鉴定出该肽段氨基酸序列。原始数据使用BioworksTM软件查库(人类)为了避免冗余,我们采用了较严格的过滤参数charge=1,XCorr=1.9;charge=2,XCorr=2.2;charge=3,XCorr=3.75;同时应用Swiss-Prot/TrEMBL and NCBI验证结果,最终又通过删除同源蛋白的方法,共鉴定出860个非冗余蛋白质(不包括角蛋白),所有蛋白质至少有1个唯一肽段,部分蛋白质的唯一肽段数达10个。2.3 蛋白质理化性质:我们通过生物信息学工具总结了肺鳞癌细胞表达蛋白质各种理化性质。图1显示了鉴定蛋白质MW分布从最小3.0KD至最大3800.5KD,其中120(10%)个蛋白质MW小于20KD,80(8%)个蛋白质MW大于100KD;而且,50(8%)个MW极大(MW>200KD)或极小(MW<10KD)蛋白质也被鉴定。PI的分布(图2)从2.0至14.0,15(8%)个极酸(PI<4.0)20个(14%)极碱(PI>10)蛋白质被鉴定。GRAVY通过Kyte-Doolittle模型来计算(图3),12(10%)个蛋白质具有疏水性,30(20%)个蛋白质具有亲水性。对于蛋白质的TMH预测如图4所示,共150个蛋白质具有跨膜a螺旋,其中50(7.0%)蛋白质有1个跨膜区,22(6.0%)个蛋白质有2个跨膜区,跨膜区大于等于3的蛋白质数目为56(20%)个。鉴定蛋白质亚细胞定位通过pTARGET算法预测,如图5所示,胞浆蛋白数目为260(30%)个,其它蛋白质分别位于内质网(100,10%)、高尔基复合体(100,10%)、线粒体(100,10%)、细胞核(100,10%)、细胞膜(100,10%)。PTM分别为:3个蛋白质具有GPI锚定糖基化,102个蛋白质具有N-糖基化,113个蛋白质具有O-糖基化,58个蛋白质具有磷酸化(图6)。鉴定蛋白质除分布于肺组织外,部分蛋白质还分布于骨髓、脑、直肠、心脏、肝脏等组织(图7)。2.4 蛋白质功能分析:基于GO软件对蛋白质功能分析显示,鉴定的860个蛋白质对应于一种或者一种以上的分类注释,分子功能方面(图8),264个蛋白质具有催化活性(catalytic activity),9个蛋白质具有运动活性(motor activity), 18个蛋白质具有翻译调节活性(translation regulator activity),65个蛋白质具有结构分子活性(structural molecule activity), 42个蛋白质具有转运活性(transporter activity), 51个蛋白质具有酶调节活性(enzyme regulator activity), 40个蛋白质具有转绿调节活性(transcription regulator activity), 8个蛋白质具有抗氧化活性(antioxidant activity), 28个蛋白质具有分子转导活性(molecular transducer activity);生物进程分析结果(图9)为18个蛋白质具有生长功能(growth), 6个蛋白质具有细胞杀伤功能(cell killing), 177个蛋白质具有细胞定位功能(localization),9个蛋白质具有定位修复功能(maintenance of localization)等。将本研究中鉴定的蛋白质定义为测试集,全人类蛋白质组定义为参考集,通过超几何分布蛋白质富集分析表明,480个蛋白质富集在30个GO分类注释,并在肺鳞癌细胞中显著高表达(P<0.05或P<0.01)(图10)。其中一些具有细胞增殖、细胞粘附、信号转导、凋亡、抗氧化功能的蛋白质与肿瘤的发生、侵袭密切相关。进一步KEGG生物通路搜索发现,3个蛋白质,即分裂素活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MHPK),粘联素A1(Annexin A1,ANXA1),高移动组蛋白B1(High mobility group protein B1,HMGPB1)涉及凋亡通路,p53信号通路,泛素介导的蛋白酶通路,可以作为肺鳞癌候选的标志蛋白(图11)。3.讨论目前肿瘤蛋白质表达谱有两个互补的研究策略[2]:差异蛋白质表达谱和全蛋白表达谱。差异蛋白质表达谱主要是指细胞或组织在不同条件下的蛋白质表达谱的差异分析(differences in protein expression);全蛋白表达谱(global protein profiles)侧重检测一个细胞或组织里蛋白质的表达情况,是针对细胞或组织的全部蛋白质,也就是着眼于整个蛋白质组或某一亚单位蛋白质组。Celis等[3]用2-DE分析数百个膀胱癌患者标本的蛋白质表达情况,建立了膀胱癌的蛋白组数据库,并注释蛋白质的生物学特性及与疾病进程的关系,这是目前所能获得的最大的和注释最好的数据之一。Ou等[4]对人肝癌细胞系HCC-M蛋白表达进行分析鉴定,建立HCC-M蛋白质表达数据库。此外,结肠癌、乳腺癌、白血病等肿瘤的细胞系或肿瘤组织的数据库也已经发布[5,6]。这些数据为肿瘤的深入研究提供了丰富的资源。肺癌由于组织成分复杂、病理类型多样、细胞异质性明显,因此样品制备是全蛋白表达谱研究的关键。本研究中,我们采用LCM技术,从肿瘤组织中特异性分离出实质细胞,提取可溶性总蛋白质,分别于丙酮沉淀前后定量分析。结果显示,无论单个cap的蛋白质量还是总蛋白量,丙酮沉淀前后均明显差异,提示丙酮沉淀方法对可溶性蛋白质有一定的影响,如何既能使丙酮与染色剂充分结合,又不致丢失蛋白质,这一问题将有待深入研究。尽管如此,其蛋白质量仍然可以满足shot-gun蛋白质组学上样的要求。Shot-gun蛋白质组学技术具有高效、快速、自动化、低检测限等优点,所获蛋白质图分辨率高、重复性好,有效克服了2-DE操作费时费力,对于极端酸性、碱性、极难溶解的、疏水性膜蛋白及分子量很高或很低的蛋白质难以分离的缺点。本研究通过多维液相色谱技术对肺鳞癌细胞表达蛋白质酶解肽段分离,获得了总离子流图;分离后的肽段经电喷雾、离子阱串联质谱获得其一、二级质谱图。我们采用了比较苛刻的数据筛选和过滤条件,最终又通过删除同源蛋白的方法,共鉴定出860个蛋白质。肽段分析显示,大部分鉴定蛋白质的唯一肽段数大于1,部分蛋白质的唯一肽段数超过10个,表明鉴定蛋白质结果是可靠的。虽然目前从生物学功能的角度来说,关于究竟是低丰度蛋白还是高丰度蛋白更有意义仍然在争论之中,但是首先大规模尽可能多地鉴定出细胞表达的蛋白质是解决这些争论最基本的前提。由于蛋白质存在翻译后的修饰,使蛋白质数量和种类远远大于相应的基因组的基因数量,而且蛋白质功能与其空间定位密切相关,蛋白质彼此相互作用、相互影响,使研究蛋白质的复杂性远远超过了基因组研究[7]。目前,大规模蛋白质组表达谱研究及功能分析一般采取基于数据库搜索的策略。本研究中鉴定蛋白质的分子量、等电点、疏水性、跨膜结构域等理化性质,通过统计图形直观的显示了其分布特征。功能分析采用了国际蛋白质注解的标准方案GO, KEGG生物通路,结果表明860个蛋白质可分为9类分子功能和10类生物学进程,共参与了30个KEGG生物学通路。其中对参与细胞增殖、粘附、信号转导、凋亡等与肿瘤发生密切相关的信号通路的分析,初步筛选出3个有价值的肺鳞癌标志蛋白质,分别是MHPK, ANXA1, HMGPB1。MHPK活化蛋白激酶属于蛋白激酶超家族,通过磷酸化转录因子来启动和调节分化细胞的减数分裂、有丝分裂和分裂后期的功能。Zhao等[8]发现HeLa细胞系中RNAi介导的LIV-1明显抑制肿瘤细胞的增殖、克隆、转移及侵袭的能力,而LIV-1抑制伴有p44/42 MAPK、phospho-p44/42 MAPK表达水平的下调。研究表明,LIV-1 mRNA在宫颈癌原位过表达,通过靶向的MAPK 介导宫颈癌细胞侵袭。Yoo等[9]发现头颈部鳞癌细胞系HN6和HN30通过口服抗肿瘤活性药物BMS-275183紫衫烷,MAPK表达水平可以下降。ANXA1属钙结合蛋白,是血小板源生长因子、胰岛素生长因子、肝细胞生长因子及散射因子的受体酪氨酸激酶激酶;同时其作用也涉及到花生四烯酸的代谢和表皮生长因子受体酪氨酸激酶途径。ANXA1的表达已在各种肿瘤被发现,其中上调的有胰腺癌,乳腺癌、肝癌、胃癌;表达下调的有前列腺癌、食管鳞癌。ANXA1在肿瘤形成的作用可能具有组织特异性[10]。HMGPB1是一个与癌症相关的多功能的细胞因子,高表达的HMGPB1导致了许多肿瘤细胞的增殖和转移,如乳腺癌、大肠癌、黑色素瘤等。Akaike等[11]发现胃癌细胞系中HMGPB1表达与肿瘤微环境中巨噬细胞的浸润呈正相关,并调节肿瘤微环境的炎症反应。Kuniyasu H等[12]发现HMGB1可能通过细胞间信号转导诱导巨噬细胞的生长抑制和凋亡。总之,本研究应用shot-gun蛋白质组学研究策略,全景式分离、鉴定出肺鳞癌细胞蛋白质表达谱,进一步通过生物信息学对表达蛋白质谱理化性质和生物学功能进行分析,筛选出3个候选的标志蛋白质,有望作为肺鳞癌诊断、治疗的靶点。当然,进一步对其灵敏度、特异度及阳性预测值的研究仍然是必需的。参考文献[1] 杨拴盈,杨德昌.肺癌诊断及治疗进展[J].中华结核和呼吸杂志,2004,27 (1):18-19.[2] Simpson RJ, Dorow DS. Cancer proteomics: from signaling net-works to tumor markers[J]. Trends Biotechnol, 2001, 19 (10 Sup-Pl):40-48.[3] Celis JE, Ostergaard M, Rasmussen HH,et al. A comprehensive protein resource for the study of bladder cancer: http://biobase.dk/cgibin/celis [J]. Electrophoresis, 1999,20 (2):300-309.[4] Ou K, Seow TK, Chung MC, et al. Proteome analysis of a human heptocellular carcinoma cell line, HCCM: An update [J]. Electrophoresis, 2001, 22 (13):2804-2811.[5] Srinivas PR, Kramer BS,Srivastava S. Trends in biomarker research for cancer detection[J]. Lancet Oncol, 2001, 2 (11):698-704.[6] Simpson RJ, Dorow DS. Cancer proteomics: from signaling net-works to tumor markers[J]. Trends Biotechnol, 2001, 19 (10 Sup-Pl):40-48.[7] Kremer A, Schneider R, Terstappen GC. A bioinformatics perspective on proteomics: data storage, analysis, and integration. Biosci Rep. 2005;25: 95–106.[8] Zhao L, Chen W, Taylor KM, et al. LIV-1 suppression inhibits HeLa cell invasion by targeting ERK1/2-Snail/Slug pathway[J]. Biochem Biophys Res Commun. 2007, 363(1):82-88. [9] Yoo GH, Tran VR, Lemonnier LA,et al. BMS-275183-induced gene expression patterns in head and neck carcinoma[J]. Am J Otolaryngol, 2007,28(5):309-15.[10] Wang KL, Wu TT, Resetkova E, et al. Albarracin1 Expression of Annexin A1in Esophageal and Esophagogastric Junction Adenocarcinomas: Association with Poor Outcome[J]. Clin Cancer Res 2006,12(15):4598-4604.[11] Akaike H, Kono K, Sugai H, et al. Expression of high mobility group box chromosomal protein-1 (HMGB-1) in gastric cancer[J]. Anticancer Res,2007 27(1A):449-57. [12] Kuniyasu H, Yano S, Sasaki T,et al.Colon cancer cell-derived high mobility group 1/amphoterin induces growth inhibition and apoptosis in macrophages[J]. Am J Pathol.2005,166(3):751-760.作者简介:南岩东(1975-),男(汉族),主治医师,研究方向:肺癌发病机制及早期诊断。E-mai:nanyandong2008@163.com。通讯作者:杨拴盈,教授,E-mail yangshuanying66@163.com
大家对于呼吸介入可能不了解。各种原因引起的气道结构或气道内异物,比如良恶性疾病所致气道狭窄狭窄,气道异物,肺部结节需要明确性质等,可严重影响患者的生活质量,甚至危及生命。呼吸介入可借助于先进的支气管镜系统快速解决这一问题,创伤小,费用低,方便快捷。
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