神经内科为医院重点专科之一。常年收治各种神经系统常见病、多发病及疑难危重病患者，擅长于脑血管疾病、周围神经疾病、脊髓病、运动障碍、头痛、癫痫、痴呆、神经系统感染与脱髓鞘病、肌病等诊治。2003年始在泉州地区率先开展颅内血肿微创清除术治疗脑出血患者，具有成功率高、临床费用低、创伤小、住院时间短等优点，其中年龄最长者95岁，最小者6岁。