中国人民解放军总医院第六医学中心儿科由住院部，门急诊，实验室三部分组成。住院部包括造血干细胞移植层流病房、血液肿瘤、新生儿重症监护、神经及康复专业4个专业病区，共计床位127张。中国人民解放军总医院第六医学中心儿科除普通常见疾病诊治外，专业特色突出，以新生儿、神经、血液为优势专业，各专业在全国及北京市享有较高学术地位。