感染性疾病科是锡林郭勒盟唯一以传染性疾病诊疗为主的科室，拥有两个病区，共开设床位26张。拥有优秀的专家团队，其中主任医师2名，副主任医师2名，主治医师3名。主要针对结核病（包括耐药结核病）、流感、手足口病、猩红热、病毒性肝炎肝炎肝硬化、HIV感染、痢疾、感染性腹泻等常见传染病，以及布氏杆菌病等人畜共患病。