呼吸科为医院重点学科之一，经十几年的努力，目前呼吸科具有很强的临床医疗、科研和教学的综合实力，是福州市医学会呼吸病学分会主委单位。现呼吸科设二个病区和RICU（呼吸重症监护病房），共有130张病床。

开展医疗项目：

呼吸科还设有肺功能室、雾化室、变应原检测室、脱敏治疗室和呼吸

实验室等并开展以下项目：

1、支气管镜检查与治疗

2、内科胸腔镜检查与治疗

3、变应原检测

4、支气管扩张与激发试验

5、血液气体分析

6、呼吸功能各项检查

7、脱敏治疗

8、无创或有创机械通气技术

9、盐气溶胶治疗

10、CPAP治疗各型睡眠呼吸暂停综合征

二、呼吸科门诊

呼吸科开设呼吸内科门诊，哮喘专科门诊和慢性咳嗽专科门诊，周一至周六均设有专家坐诊，周日设节假日门诊。