染色体芯片分析简介

染色体芯片分析（chromosomal mlcroarray analysis，CMA）技术又被称为“分子核型分析”，能够在全基因组水平进行扫描，可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV)，尤其是对于检测基因组微缺失、微重复等基因组失衡异常等方面具有突出优势。

据芯片设计与检测原理的不同，CMA技术可分为两大类：基于微阵列的比较基因组杂交（array-based comparative genomic hybridization，aCGH）技术和单核苷酸多态性微阵列（single nucleotide polymorphism array，SNP array）技术。前者需要将待测样本DNA与正常对照样本DNA分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果，而后者则只需将待测样本DNA与一整套正常基因组对照数据进行对比即可获得检测结果。

通过aCGH芯片能够很好地检出CNV，而SNP芯片除了能够检出CNV外，还能够检测出大多数的单亲二倍体（uniparental disomy，UPD）和多倍体，并且可以检测到一定水平的嵌合体（mosaicism）。而设计涵盖CNV+SNP检测探针的芯片，可同时具有CNV和SNP芯片的特点。

一CMA技术优势

1、高检出率原因不明的发育迟缓/智力障碍（developmental delay/intellectual disability,DD/ID）、先天多发畸形（multiple congenital abnormalities,MCA）以及自闭症（autism spectrum disorders,ASD）患者而言，CMA的诊断率（15～20%）与常规染色体核型分析（3%）相比高出5倍左右，能大幅度提高检出率；Reddy等报道，在3822例核型分析正常的胎儿样本中，通过CMA分析在104(2.7%)例样本检测到致病性CNV；2009年Hochstenbach等人利用回顾性分析的方法在36,325疑似DD患儿中通过CMA检测发现19%的致病性CNV。

2、高分辨率常规染色体核型分析的分辨率仅为5～10 Mb，而CMA则可达到10～100 Kb，并且可以提供精确断裂点信息。

3、高敏感性CMA可检测全基因组范围内的基因组失衡，包括着丝粒/端粒等重复序列密集的区域以，涵盖所有已知的微缺失/微重复综合征相关区域。

二CMA检测临床适应征

1、不明原因的智力落后/发育迟缓（DD/ID）2、自闭症侯群（ASDs）3、先天性多发性畸形（MCA）4、不明原因反复流产5、B超提示胎儿发育异常6、NIPT提示高风险7、流产物

注：CMA检测尤其适用于核型分析结果正常但是表型异常的患儿的检测。

可选CMA芯片类型

一、180k CGH array该款180K芯片共包含174,324寡核苷酸探针，覆盖全基因组并进行全基因组范围内CNV的检测；

1.针对1700个目标基因的外显子区域进行了加密设计，可最大程度提高对智力障碍、发育迟缓、先天异常和自闭症相关染色体畸变的检测能力；

2.可以有效、可靠地检测包括非整倍体、其他非平衡性的染色体重排等异常。

二、180K SNP+CGH array

在180K芯片的基础上添加了更多的SNP探针，可用于检测X染色体上纯合子（ROH）以及单亲二倍体（UPD）等区域的异常。

1.ROH不仅可证明先证者与父母的亲缘关系，同时对于常染色体隐性遗传病的致病基因来说，大大增加了其检出的可能性；

2.对于UPD而言，是指染色体上的两个拷贝或者染色体的某个区域同时遗传自双亲的一方。UPD主要与新生儿期糖尿病，Beckwith-Wiedemann综合征，Prader-Willi/Angelman症候群以及Russell-Silver综合征等相关。

CMA结果

对于变异结果的报告应包括以下信息：该变异的定位信息，剂量效应，大小，基因组坐标以及变异类型。条件允许的情况下，会在报告解释部分做出关于该变异致病性的明确声明。

样本要求（Specimen Requirements）

样本类型：外周血或者DNA或流产物组织

储存容器：EDTA抗凝管（紫色头盖）（外周血）、无菌EP管（DNA）

样本要求：1、外周血：2~3ml，轻轻上下颠倒混匀8-10次，防止血凝；2、DNA：每个DNA样本至少3-5μg，浓度大于50ng/μl，OD值260/280为1.8-2.0。3、流产物：

1）早孕自然流产尽量采集绒毛及胚芽组织，置于密闭无菌试管或医用无菌橡胶手套（无滑石粉等）中，可用无菌生理盐水浸泡，于流产、采集流产物后24小时内送检，常温保存，切勿冷藏。

2）流产胚胎（绒毛）：请在吸、刮绒毛后从吸管的无菌端去除并置于无菌纱布上，嘱送检物采集医师注意与蜕膜相鉴别，确定为绒毛组织或胚芽后将标本浸泡于无菌生理盐水中，置于密闭无菌试管或医用无菌橡胶手套（无滑石粉等）中，于流产、采集流产物后24小时内送检，常温保存，切勿冷藏。

3）引产的异常胎儿：取胎儿脐带血2~3ml于血常规采血管（EDTAK2抗凝，紫色或浅紫色帽）中，请摇晃均匀，避免凝固。或1立方厘米大小的皮肤组织（约一指节大小），置于密闭无菌试管或医用无菌橡胶手套（无滑石粉等）中，于流产、采集流产物后24小时内送检，常温保存，切勿冷藏。

3、送检物的保存：送检物可用无菌生理盐水浸泡，也可直接放置于密闭无菌试管或医用无菌橡胶手套（无滑石粉等）中，于流产、采集流产物后24小时内送检，常温保存，切勿冷藏。

送检物的标记：送检物需注明病人姓名、联系方式、流产时间及采集时间、检验类别（胎儿染色体分析或DNA芯片等）、胎儿周数，若为多胎需分别标记注明。

保存方式：2～8℃冷藏保存，如短期内不送检，请于-20℃低温保存。运输条件：1、短程：冰袋运输，温度保存2～8℃；2、长途：干冰运输（2天以上的运输路程建议放5kg以上的干冰。

本中心可以常规开展羊水，绒毛，外周血，胎儿流产物的染色体芯片的检测。2-3周出报告。

联系我们0371-68064778接通后摁“6”号键染色体芯片。