需氧菌可能也参与了男性非淋菌性尿道炎的发病

原因①滥用抗生素菌群失调，尿道敏感菌受到抑制，耐药菌大量繁殖；②包括非淋菌性尿道炎(NGU)在内的复合性下尿路感染致使下尿路粘膜屏障被破坏，导致尿道细菌大量繁殖；③性交时，（对于女方致病力小的）细菌进入尿道，因尿道急性炎症期而大量繁殖；此外，口交时，除性病性微生物外，性伴侣口腔的厌氧菌、需氧菌、某一些病毒也进入尿道而乘急性炎症之机而大量繁殖；肛交则是肠球菌、肠杆菌的直接定植浸入尿道。

常见需氧菌：肠杆菌、肠球菌、腐生葡萄球菌、金葡菌、溶血葡萄球菌，（甲型、肺炎、乙型、缓症）链球菌、（致病力弱的）表皮葡萄球；厌氧菌：丙酸杆菌；牙结石中的纳米细菌。