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2004年根据卫生部有关文件,该院对原有的发热门诊、肝炎门诊和肠道门诊进行了重新调整,成立了感染性疾病科(简称:感染科)。组建后经历了禽流感、HINI甲型流感等传染病疫情爆发,在控制疫情进一步扩散、危重病人的诊治等方面均出色完成上级给予的任务。2009年以该科人员为骨干成立的发热临时病房,收治了全省三甲综合医院最多的危重甲流病例,获福建医科大学附属协和医院2010年度“突发公共事件中表现突出的先进集体”荣誉称号。经过数年的发展,该科目前设有肝炎、发热、肠道三个专科门诊(肠道门诊时间为每年4~10月),发热、肠道病人的隔离病房各1间、共2张床位,普通病房5张床位。现有医师4人,主任医
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