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原创 基因检测中突变丰度是什么

卢云鹤 主治医师 复旦大学附属肿瘤医院 神经外科
2019-03-30 1102人已读
卢云鹤 主治医师
复旦大学附属肿瘤医院

要说清楚到底什么是突变丰度,需要首先给大家介绍一个临床概念:复旦大学附属肿瘤医院神经外科卢云鹤

在学术上,有敏感突变却靶向治疗无效的情况被称为“靶向初次抵抗”。目前我们认为是肿瘤异质性导致了这个情况的发生。

什么是肿瘤异质性?可以这样简单理解:把不同的肿瘤细胞比作各种颜色乒乓球,把穿刺活检比为抽奖,一次穿刺就是抽一次奖,允许一次多拿几个球。大家可以想象一下,假设有100多种肿瘤细胞就有100多种颜色的球,每次只能拿到其中的几种颜色的球,这部分的球(肿瘤细胞)不可能代表所有的肿瘤组织。这就造成了肿瘤治疗的困难性。

  突变丰度是体现肿瘤异质性的一个重要指标。肿瘤组织里有各种不同的肿瘤细胞。不同的肿瘤细胞携带不同的突变基因,而穿刺是不可能取到同样的若干个相同的肿瘤细胞,所以不可能有100%突变的基因(胚系突变除外)。基因突变丰度越高就说明肿瘤组织中含有这种突变基因的细胞数越多。

突变丰度与靶向效果是有关系的,但并不能说是唯一关系,对于突变丰度高依旧靶向无效的患者,有可能是存在其他的耐药突变位点。市面上说ARMS的检查灵敏度比NGS高,但都是成本问题,只要NGS测序深度足够深,灵敏度肯定高于ARMS,当然这会更贵。而ARMS一次检测单一位点,不能发现其他靶向突变或者耐药突变,为了追求高灵敏牺牲全貌性是得不偿失,而且低的突变丰度的靶向效果还不好!

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卢云鹤 主治医师

复旦大学附属肿瘤医院 神经外科

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