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胆囊结石的症状也不完全相同，有的仅表现慢性消化不良，可以有嗳气、恶心、纳差和上腹轻度胀痛。这些症状没有特殊性，很多其他疾病都可以有这些症状。譬如胃溃疡、胃癌、十二指肠溃疡、慢性胰腺炎等。腹腔内其他脏器疾病都可以具有这些症状，甚至腹腔之外心肺胸膜也可以表现这些症状。因此患者去医院求诊时，医师既不问详细病况，又不做体格检查，甚至病人话未说完，就开出处方或开出超声波检查申请单，如此看病就可能发生误诊。因为胆囊结石用超声波检查是十分容易发现确定的。如果有胆囊结石，也有可能为其他疾病引起。一旦发现常见的胆囊结石，医师就不加深究，都归罪于胆囊结石。甚至立即住院手术，入院后也不详细了解病史和体格检查，一切仰仗各种特殊检查和化验。
胆囊结石另一症状是突然发生上腹部或右上腹急性绞痛，疼痛剧烈有阵发性倾向。腹痛可在进食后或夜间突发，持续15分钟到数小时，疼痛起于上腹部，可以转移至背部。此种绞痛消失后，仍有上腹部胀痛1-2天。绞痛发作可间隔数周、数月甚至数年后再发生，但不会每天都有绞痛发作。
胆囊中胆石可以排出进入胆管，此后再进入小肠随大便解出。胆囊可以不断产生结石，较小结石则经常自然排出。如果胆囊结石较大，其直径超过细小胆管则不易排出，发生嵌顿引起绞痛。即使服用各种具有排石美名的药物，也不能证明已排出，不用药物也自然有结石排出。胆石排出并非好事，因为一旦发生阻塞胆管，即可发生绞痛，甚至感染发热；阻塞胆总管可以发生黄疸，或发生急性胆石性胰腺炎。胆囊中小结石即使排出仍可再生，胆石排出不是此病已愈，故若不去除胆囊，即使去尽胆囊中结石，仍会继续产生结石。因此胆囊结石留在胆囊之中不排出来比排出为好。即使因此发生胆囊炎，治疗就简单多了，切除胆囊即可，术后一周余即可出院。如果胆管中有结石，阻塞胆汁流至小肠可引起感染发炎和黄疸，需切开胆管取石解除阻塞，住院时间就长达3-6周。如发生胆性胰腺炎则住院手术后恢复时间更长，且重症胆石性胰腺炎是有致命危险的并发症。实际上一些所谓排石药物和方法并没有确切的证据，较小胆囊结石自然排出，即使排出也不能认为治愈。排出途中受阻则发生并发症，危害不小。因此胆石症一旦发生黄疸，即皮肤和眼呈黄色，患者可有寒战发热，此时则必须住院治疗。
应该记住，如果没有疼痛，一旦发生黄疸和尿色深黄，不宜对症治疗，必须住院检查查明病原，因为不一定是胆石引起。
