Nature子刊：肿瘤微生物组或可预测肿瘤预后和药物反应

Nature Communications[IF:14.919]

① 在肾上腺皮质癌、宫颈鳞状细胞癌、脑低级胶质瘤和皮下黑色素瘤这四种癌症类型中，与单独的临床协变量相比，肿瘤微生物丰度是更好的预后预测指标；② 在更广泛的癌症中，肿瘤基因表达是一个比微生物丰度更有力的预后预测因素；③ 在五种癌症-药物对中，包括多西他赛治疗乳腺浸润癌和肉瘤，及几种治疗胃腺癌的药物，肿瘤微生物丰度比单独的临床协变量更能预测病人的药物反应；④ 结合肿瘤微生物丰度和基因表达特征，可以适度的改善预测性能。

Predicting cancer prognosis and drug response from the tumor microbiome

05-24, doi: 10.1038/s41467-022-30512-3

【主编评语】在一些癌症中，肿瘤基因表达可以预测病人的预后。然而，RNA- seq和全基因组测序数据不仅包含来自宿主肿瘤和正常组织的读数，还包含来自肿瘤微生物组的读数，因此可以用来推断每个肿瘤中的微生物丰度。Nature Communications近期发表的研究表明，肿瘤微生物丰度，单独或与肿瘤基因表达相结合，可以在一定程度上预测癌症预后，及药物反应。未来可以利用现有的测序技术，或开发新的协议，从RNA-seq和全基因组测序实验中获得更多关于预后和药物反应信息。（热心肠日报）