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付锦华
付锦华 主任医师
北京嘉禾妇儿医院 妇科

早期胚胎发育表观遗传学甲基化和基因印记。

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今天来说说早期胚胎发育表观遗传学甲基化和基因印记。先说几个概念:

01甲基化

甲基化是DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变DNA片段活性、从而改变遗传表现,是一种表观遗传修饰。它在调控基因表达、胚胎发育、细胞增殖、细胞分化、维持基因组稳定和抵御外源DNA病毒入侵等生物学过程起到了至关重要的作用。

02基因印记

基因印记是一种不遵循孟德尔定律、依靠单亲传递某些遗传学性状的现象,某些基因呈亲源依赖性的 单等位 基因表达,另一等位基因不表达或表达极弱。当基因发生印记时,等位基因是否表达,取决于它来自母系还是父系,其中父系等位基因不表达者就称为父系印记,而母系等位基因不表达者就称为母系印记。印记基因对胎儿和出生后早期生长发育、某些疾病的易感性和免疫性、肌肉骨骼的生长发育起着至关重要的调控作用。基因印记是DNA甲基化造成的。DNA甲基化的实现需要DNA甲基转移酶(DMT)的参与,需要甲基供体,甲基化特定的碱基。甲基化的作用是关闭基因活性,去甲基化的作用则是活化基因表达。

早期胚胎发育过程非常短,这个过程就是五,六天时间,细胞从一个高度特化的配子,然后形成了一个全能性的胚胎,很快又会发生分化,形成一个着床前的具有两种主要细胞类型:滋养外胚层,内细胞团的结构,然后就可以着床,形成正常胚胎,这个过程虽然短,细胞命运变化却非常剧烈,基因表达调控变化也非常剧烈。对应的早期胚胎发育,还有细胞重编程,让一个体细胞到一个全能性胚胎,或者是一个多能性的干细胞,在这个过程中,基因组DNA序列是没有改变的。

03中心法则

再说说中心法则,就是从DNA转录到RNA,RNA再翻译成蛋白质,然后来行使功能。在这个过程中不是所有的DNA都能转录成RNA,也不是所有的RNA全都翻译成蛋白质。每一个层级都受到严格的调控,有DNA的甲基化还有羟甲基化修饰。DNA不是裸露的,是缠绕在核小体上面,核小体是组蛋白8聚体组成的,组蛋白上又有很多修饰,这些修饰调控基因是否可以被转录。

在人类,两个配子精卵受精结合之后,要发生表观遗传事件,就是DNA去甲基化,去甲基化之后一些基因会被激活,表达基因功能。但是很快又要被沉默,去甲基化后一两个细胞周期,就要被沉默。是怎么被沉默的呢?

有学者做了研究:在人早期的胚胎,有四细胞期,八细胞期,去甲基化后胚胎基因组激活起来,在这几个非常关键的阶段,胚胎做了H3K4,K27,K9三个特别重要的组蛋白修饰,K4跟K27主要是在基因的启动子上,都是先从配子先擦掉,然后再重建这两种修饰,但是K9是逐渐加上去,因为它在M2卵母细胞里面很少,慢慢加上去,在四细胞,八细胞,囊胚都有特定区域,这些区域是主要是转座子或者是逆转座子。K9加上去,把这些转座子沉默掉。K9三甲基化和DNA甲基化就像接力一样,DNA甲基化没了,K9三甲基化要加上去,使之被沉默掉,不让基因组受到伤害,在早期胚胎里面,是特别重要的一个事件。

早期胚胎发育,实际是一个母源到胚胎的一个转换,卵母细胞是身体里面最大的细胞,150微米,在这个细胞胞质里储存了大量的RNA,这些RNA很重要,要翻译成蛋白质,支持胚胎的后期发育,这些RNA之后要被降解掉,降解是受RNA修饰调控的,把这个修饰去掉,RNA就不能被降解掉,胚胎发育也是受影响的。

在卵母细胞里面敲掉一个甲基化酶,那这个卵就不能继续往下发育。如果做卵源敲除胚胎就不能发育,很快就会死掉,RNA修饰毫无疑问很重要。

全基因组测序之后,有接近40-50%序列是转座子(跳跃基因),在体细胞里面,这些转座子都是通过DNA甲基化沉默掉,如果不沉默,跳来跳去,基因组就乱了,就不是一个正常的生物了。当然这种沉默,也是受基因甲基化调控的。

DNA甲基化、去甲基化、组蛋白修饰、RNA修饰对特定基因的修饰和细胞的正常分化起着关键作用。细胞的表观遗传特征可以被环境条件所改变。这些情况主要是指生活方式,如饮食习惯,受教育程度,社会经济地位,精神状态和吸烟。一些异常的环境条件可以使表观遗传畸变 ,基因印迹错误,细胞特异性DNA和组蛋白修饰模式破坏,导致一些疾病的发生和发展。

付锦华
付锦华 主任医师
北京嘉禾妇儿医院 妇科